четверг, 29 октября 2009 г.

Indigo

Мы открыли сайт с программными продуктами для органической химии, которые разрабатывались с 2004 года. Продукты реализованы на C++ и объединены в тулкит под названием Indigo.
  • Bingo: картридж (плагин) к СУБД Oracle с реализацией различных видов «химического» поиска молекул и реакций.
  • Dingo: библиотека для рендеринга молекул и реакций, с обёрткой на C# и command-line утилитой.
  • Cano: библиотека для подсчёта canonical SMILES — уникального представления молекулы, с обёрткой на C#.
  • Deco: библиотека и command-line утилита для разложения набора молекул на общую часть и заместители (R-Group deconvolution)
  • Nucleo: библиотека для работы с нуклеотидными цепочками, с обёрткой на Java.
Поддерживаемые платформы — Windows, Linux, Mac OS X, Solaris на SPARC.

Дистрибутивы и исходники бесплатно выложены под GPL v3. В исходниках, кроме всего необходимого для работы с молекулами и реакциями, можно добыть немало реализаций общих алгоритмов на графах:
Краткий перечень этих и других реализованных алгоритмов находится на странице ресурсов.

Мы открыли три публичные почтовые рассылки:

Ещё раз адрес сайта: http://ggasoftware.com/opensource/indigo/.

Команда разработчиков находится в Санкт-Петербурге. Будем очень рады любым комментариям, вопросам, сообщениям об ошибках.

Комментариев нет: